基于深度学习的图像分割#

在本章中，我们将使用基于深度学习的算法进行图像分割。

安装要求#

为了使用 cellpose 和 stardist，必须安装以下依赖项：

mamba install cellpose pytorch=1.8.2 cudatoolkit=10.2 -c pytorch-lts
pip install tensorflow
pip install stardist

本文件夹中的笔记本已使用以下版本进行测试：

  • torch==2.0.1

  • stardist==0.8.3

  • tensorflow==2.12.0

  • csbdeep==0.7.3

  • cellpose==2.2.1