图像反卷积#
图像反卷积实际上也只是一种特殊形式的图像滤波。我们专门用一整章来讨论它,因为反卷积在荧光显微镜技术中扮演着重要角色。
我们将在二维图像中演示其原理。不过需要强调的是,如果可能的话,反卷积应该在三维空间中进行,因为其背后的物理原理在各个方向上并不相同,在荧光显微镜中点扩散函数通常是不对称的。
安装依赖#
我们将使用RedLionFish和SimpleITK来对图像进行反卷积。为了便于使用,我们将通过一个便利层napari-simpleitk-image-processing来使用后者。在终端中输入以下命令来安装所有内容:
mamba install reikna pyopencl -c conda-forge
pip install redlionfish
pip install napari-simpleitk-image-processing