Superponer textos en imágenes

Después de etiquetar elementos en una imagen, es posible que se desee ver algún texto sobre cada elemento describiendo, por ejemplo, su área, o simplemente el número de etiqueta de ese elemento. Una forma de hacerlo es utilizando la función annotate de los ejes de matplotlib.

Temas relacionados anteriores:

• Etiquetar imágenes

• Análisis cuantitativo de imágenes

from skimage.io import imread
import matplotlib.pyplot as plt
from skimage import measure
import pyclesperanto_prototype as cle

Primero abrimos una imagen y etiquetamos objetos en ella.

# Load data
blobs = imread('../../data/blobs.tif')
cle.asarray(blobs)

cle._ image shape (254, 256) dtype float32 size 254.0 kB min 8.0 max 248.0

labeled_blobs = cle.voronoi_otsu_labeling(blobs, spot_sigma=3.5)
labeled_blobs

cle._ image shape (254, 256) dtype uint32 size 254.0 kB min 0.0 max 65.0

Luego, analizamos los elementos etiquetados y obtenemos sus propiedades.

# Analyse objects
regionprops = measure.regionprops(labeled_blobs)

Finalmente, utilizamos la función axs.annotate() con los siguientes argumentos:

• text: la cadena de texto a mostrar;

• xy: las coordenadas donde se dibujará el texto;

• fontsize: el tamaño del texto;

• color: el color del texto;

# Visualization
fig, axs = plt.subplots(1, 1)
cle.imshow(blobs, continue_drawing=True, plot=axs)
cle.imshow(cle.reduce_labels_to_label_edges(labeled_blobs), labels=True, plot=axs, continue_drawing=True, alpha=0.7)

# Plot label number over each element (iterate over each element)
for element in regionprops:
    # Get element centroid (x, y)
    element_centroid = (element.centroid[1]-8, element.centroid[0]+5)
    
    # Get element label and convert it to string
    element_label = str(element.label)
    
    # Plot label number at the coordinates of that element centroid
    axs.annotate(text = element_label, xy = element_centroid, fontsize = 12, color = 'white')

Como se mencionó anteriormente, podemos escribir mediciones cuantitativas sobre cada elemento, como su área.

# Visualization
fig, axs = plt.subplots(1, 1)
cle.imshow(blobs, continue_drawing=True, plot=axs)
cle.imshow(cle.reduce_labels_to_label_edges(labeled_blobs), labels=True, plot=axs, continue_drawing=True, alpha=0.7)

# Plot label number over each element (iterate over each element)
for element in regionprops:
    # Get element centroid (x, y)
    element_centroid = (element.centroid[1]-8, element.centroid[0]+5)
    
    # Get element label and convert it to string
    element_area = str(element.area)
    
    # Plot label number at the coordinates of that element centroid
    axs.annotate(text = str(element_area) + " px", xy = element_centroid, fontsize = 7, color = 'white')