Segmentación de imágenes basada en aprendizaje profundo#

En este capítulo, utilizaremos algoritmos basados en aprendizaje profundo para la segmentación de imágenes.

Instalación de requisitos#

Para utilizar cellpose y stardist, se deben instalar estas dependencias:

mamba install cellpose pytorch=1.8.2 cudatoolkit=10.2 -c pytorch-lts
pip install tensorflow
pip install stardist

Los cuadernos en esta carpeta han sido probados utilizando:

  • torch==2.0.1

  • stardist==0.8.3

  • tensorflow==2.12.0

  • csbdeep==0.7.3

  • cellpose==2.2.1