Trailer: Biobildanalyse mit Python
Den Computer einrichten
Python-Grundlagen
Nachhaltigen Code schreiben
Grundlagen der Bildanalyse
Bilddateiformate
Fernzugriff auf Dateien
Grundlagen des maschinellen Lernens
- Unüberwachtes maschinelles Lernen
- Skalierung
Bildvisualisierung in 3D
Bildfilterung
Bilddekonvolution
Räumliche Transformationen

Image Segmentation

Bildsegmentierung
Maschinelles Lernen für Bildsegmentierung
Tiefenlernen-basierte Bildsegmentierung
- Bildsegmentierung mit CellPose
- Bildsegmentierung mit StarDist
Segmentierung-Nachbearbeitung
Blob-Erkennung
- Erkennung lokaler Maxima
- Blob-Erkennung
Oberflächenverarbeitung

Quantitative analysis

Merkmalsextraktion
Nachbarschaftsanalyse in Geweben
Zellklassifizierung
Kolokalisierung
Algorithmusvalidierung
Daten simulieren
- Simulation der Bildentstehung + Bildwiederherstellung

Advanced techniques

Fortgeschrittene Python-Programmierung
GPU-beschleunigte Bildverarbeitung
Grafische Benutzeroberflächen
Gekachelte Bildverarbeitung
Stapelverarbeitung
- Wie man Dateien in einem Ordner verarbeitet
- Verarbeitung von Timelapse-Daten
Zeitraffer-Analyse
Parameteroptimierung

Appendix

Glossar
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By Robert Haase, Guillaume Witz, Miguel Fernandes, Marcelo Leomil Zoccoler, Shannon Taylor, Mara Lampert, Till Korten & add-your-name-here-by-sending-a-pull-request-containing-a-notebook

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